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新一代抗體發(fā)現(xiàn)平臺XploreSeq?——利用NGS和AI挖掘BCR免疫組庫，實現(xiàn)超快速抗體篩選
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XploreSeq? 可分析數(shù)百萬個抗體序列并推薦高度多樣化的候選分子組合——準(zhǔn)確率超過50%
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BCR免疫組庫規(guī)模龐大，包含許多具有成藥潛力的序列。一個典型的藥物發(fā)現(xiàn)項目可得到數(shù)百萬個BCR序列（如上所示）。
XploreSeq?利用經(jīng)過多年訓(xùn)練和完善的AI引擎篩選該免疫組庫，識別苗頭抗體，輕松應(yīng)對這種大海撈針式的挑戰(zhàn)。
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重建抗體譜系樹（來自真實項目）
候選抗體的質(zhì)量和多樣性都很重要。我們的目標(biāo)是從不同譜系中挑選具有高結(jié)合置信度和極佳可開發(fā)性的抗體。這將為整個項目提供多樣化的、可開發(fā)的苗頭抗體，可以覆蓋最大數(shù)量的表位，從而提高下游篩選的成功率。
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案例 1XploreSeq?高度準(zhǔn)確地識別苗頭抗體
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在該項目中，XploreSeq? 共預(yù)測了717個結(jié)合抗體，從中隨機(jī)選擇48個用于表達(dá)和測試。其中66.7%（32/48）被確認(rèn)為結(jié)合抗體，只有18.6%（6/32）的結(jié)合抗體與雜交瘤篩選的苗頭抗體重疊。
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案例 2將XploreSeq?應(yīng)用于VHH發(fā)現(xiàn)
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在該項目中，利用免疫噬菌體文庫以及Sanger測序共識別出41個獨特的VHH苗頭分子。
隨后對文庫進(jìn)行NGS測序，并進(jìn)行XploreSeq? 分析。NGS結(jié)果包括之前識別出的41個苗頭分子中的38個。此外，XploreSeq? 還預(yù)測了43個新的VHH binder。表達(dá)和測試時，上述43個分子中的30個（69.7%）被確認(rèn)為是結(jié)合抗體，相比僅利用噬菌體展示獲得的苗頭抗體，其多樣性顯著提升。
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案例 3共同輕鏈雙抗的發(fā)現(xiàn)
輕鏈在免疫組庫中的多樣性較低，因此更有可能在不同組庫中得到共同輕鏈，構(gòu)建共同輕鏈的雙特異性抗體。XploreSeq?非常適用于該應(yīng)用場景，可以采集數(shù)百萬個輕鏈序列，極大地提高了找到共同輕鏈的可能性。
在本案例中，XploreSeq? 能夠在A抗原免疫組庫中識別出一條與我們通過XtraDoma? 雜交瘤平臺得到的B抗原的苗頭抗體類似的輕鏈。我們基于這兩條輕鏈直接構(gòu)建出了兩種共同輕鏈的雙特異性抗體。這兩種分子能被較好表達(dá)且純度高，并同時與兩個靶點結(jié)合。
