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在抗體發(fā)現(xiàn)早期將可開發(fā)性納入考量
可開發(fā)性已被視為抗體臨床試驗獲得成功的關(guān)鍵驅(qū)動因素。傳統(tǒng)的“功能優(yōu)先、可開發(fā)性其次”的篩選范式是按順序進行的,并非最佳方式,時常會獲得可開發(fā)性較差的候選抗體,需要進一步工程改造。
我們提倡在篩選抗體的過程中同時考慮可開發(fā)性和功能,這可以借助我們的計算平臺實現(xiàn),不僅時間周期短而且成本極低。
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利用我們充分驗證的計算模型(兩種版本)進行全面評估
全面豐富的計算模型,包括基于物理原理的模型和基于AI的模型
利用數(shù)千個內(nèi)部數(shù)據(jù)點訓(xùn)練AI模型;在多個可開發(fā)性預(yù)測任務(wù)中實現(xiàn)了SOTA(全球最佳表現(xiàn))性能
經(jīng)過多個內(nèi)部項目的全面驗證和優(yōu)化
時間周期短(最短1周);只需提供抗體序列
高通量(HTP)版本,可快速評估多達1000個候選抗體
低通量(LTP)版本,可對部分候選抗體進行詳細的細粒度分析
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XcelDev? Silico只需序列信息即可高度準確地預(yù)測可開發(fā)性
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案例:XcelDev? Silico根據(jù)可開發(fā)性對30多個候選抗體進行評估和排序
利用XcelDev? Silico分析了36個通過了結(jié)合和功能篩選的苗頭抗體。我們預(yù)測了每種抗體的6種性質(zhì),并在0-1的范圍進行評分(以下圖中的顏色梯度顯示)。
我們計算了整體可開發(fā)性得分,對所有36個苗頭抗體進行排序。對前7位苗頭抗體(紅色方框)進行了表達以及一系列濕實驗可開發(fā)性測定,以驗證排序的有效性。所有7個苗頭化合物的測定結(jié)果均良好,Tm、SEC、AC-SINS和HIC結(jié)果如下所示。